Edward y Alphonse Elric son dos hermanos apasionados por la alquimia que intentan devolver a la vida a su madre a pesar de la prohibición absoluta de la transmutación humana. El experimento termina en desastre: Edward pierde parte de su cuerpo, mientras que Alphonse pierde el suyo por completo y su alma queda ligada a una armadura. Decididos a recuperar sus cuerpos originales, los hermanos emprenden la búsqueda de la Piedra Filosofal y descubren poco a poco que su existencia está relacionada con secretos políticos, militares y alquímicos mucho más amplios de lo que imaginaban.