Edward et Alphonse Elric sont deux frères passionnés d’alchimie qui tentent de ramener leur mère à la vie malgré l’interdiction absolue de la transmutation humaine. L’expérience tourne au désastre : Edward perd une partie de son corps tandis qu’Alphonse perd entièrement le sien, son âme étant alors liée à une armure. Déterminés à retrouver leurs corps d’origine, les deux frères se lancent à la recherche de la Pierre Philosophale et découvrent progressivement que son existence est liée à des secrets politiques, militaires et alchimiques bien plus vastes qu’ils ne l’imaginaient.