Tras la Guerra Santa contra Hades, Seiya permanece gravemente herido por la espada del dios del Inframundo. Para intentar salvarlo, Atenea y Shun viajan al pasado, hasta el siglo XVIII, durante la anterior Guerra Santa. Allí conocen a Tenma, el Caballero de Pegaso de esa época, y a Alone, un joven destinado a convertirse en el recipiente de Hades. Mientras el Santuario se prepara para enfrentarse a los Espectros, misteriosas traiciones y alteraciones provocadas por el viaje temporal complican el conflicto. Pasado y presente comienzan entonces a entrelazarse, poniendo en juego no solo el destino de Seiya, sino también el de Atenea y los Caballeros.