Hajime Saito, ex miembro del Shinsengumi, vuelve a aparecer ante Kenshin, y trata de probar sus capacidades! El gobierno pide a Kenshin que mate a Shishio Makoto, el sucesor de Battosai. Este último se convirtió en jefe de una organización clandestina, y busca tomar el control de Japón!