En 1987, Jotaro Kujo découvre qu’il possède un pouvoir surnaturel prenant la forme d’un Stand, une manifestation de son énergie capable de combattre à ses côtés. Peu après, il apprend que Dio Brando, ennemi historique de la famille Joestar, est revenu et que son existence menace directement sa mère, Holly. Accompagné de son grand-père Joseph Joestar et de plusieurs alliés eux aussi utilisateurs de Stand, Jotaro entreprend un long voyage jusqu’en Égypte pour retrouver Dio. À travers de nombreux pays, le groupe affronte des adversaires aux pouvoirs toujours plus imprévisibles. Leur périple transforme progressivement la lutte contre Dio en une course contre le temps où stratégie, volonté et maîtrise des Stand deviennent essentielles.