Han pasado tres años desde el gran cambio en la situación de Boruto y en la de Kawaki. Jubi, que manipula Código, evoluciona hacia un shinju con conciencia, y el mundo se enfrenta a una nueva amenaza! En cuanto a Sasuke, también fue absorbido por un árbol... Boruto vuelve a la aldea, pero Mitsuki el ataque repentinamente...!