Los hijos de Splinter están a punto de librar la batalla de sus vidas. ¡A apenas se ha recuperado del trágico ataque en la isla de Burnow, las tortugas y sus aliados están atrapados en un torbellino de violencia que amenaza con sumergirse en el caos en Nueva York. Mientras que el agente Bishop está promoviendo un nuevo plan para destruir a los mutantes gracias a un aliado inesperado, Karai ha vuelto, y la nieta de Shredder tiene previsto asumir la cabeza del clan Foot. La sangre corre y la guerra es declarada... Amenazada en todos los frentes, ¿el clan Hamato podrá proteger a los suyos?