El Caballero Jedi Quinlan Vos ha perdido la memoria. Sin perder un momento, necesita buscar su pasado, pero también encontrar el rastro de su Padaan, Aayla Secura, que ha desaparecido misteriosamente. Con sólo aliados su sable láser y un astuto Devaroniano llamado Villie, el Caballero amnésico tendrá que enfrentarse a jugadores mortalmente peligrosos, falsos Jedi, agentes gubernamentales corruptos y sobre todo la influencia creciente del lado oscuro de la fuerza. Esta aventura se sitúa entre los Episodos I y II de la cronología Star Wars.