Le Chevalier Jedi Quinlan Vos a perdu la mémoire. Il lui faut, sans perdre un instant, se mettre en quête de son passé mais aussi retrouver la trace de son Padaan, Aayla Secura, qui a mystérieusement disparu. Avec pour seuls alliés son sabre laser et un rusé Devaronien nommé Villie, le chevalier amnésique devra affronter des joueurs mortellement dangereux, de faux Jedi, des agents gouvernementaux corrompus et surtout l'influence grandissante du côté sombre de la force. Cette aventure se situe entre les Episodes I et II de la chronologie Star Wars.