À la fin du XIXe siècle, Jonathan Joestar voit sa vie bouleversée par l’arrivée de Dio Brando, jeune homme ambitieux recueilli par son père. Derrière son apparente courtoisie, Dio cherche à s’emparer de la fortune des Joestar et transforme progressivement leur rivalité en véritable guerre personnelle. Lorsqu’il découvre les pouvoirs d’un ancien Masque de pierre capable de changer un être humain en créature surpuissante, le conflit prend une dimension surnaturelle. Pour l’arrêter, Jonathan apprend à maîtriser le Hamon, une énergie fondée sur la respiration, aux côtés de Will A. Zeppeli. Leur affrontement pose les bases de la longue histoire de la famille Joestar.