Después de someterse a una gran cantidad de exámenes médicos y otras pruebas cognitivas, Tetsuo logra escapar del hospital. Mientras tanto, ha oído hablar de cierta persona “Akira” a quien no puede esperar a conocer. Por su parte, Kaneda y Kei intentan escapar del complejo militar donde fueron hechos prisioneros. Pero entonces un grupo guerrillero clandestino intenta descubrir los secretos que guarda el ejército...