La saga de Usagi Yojimbo (le lapin samourai) débute dans le Japon du 17ème siècle. Le temps des guerres civiles est juste révolu et le Shogun a pris le pouvoir. Les Samourai représentent la classe dominante du pays. Ils sont partout respectés pour leur code d'honneur, le bushido. Cependant, dans le pays s'installe une période de troubles et d'intrigues politiques. C'est dans cet univers qu'évolue Miyamoto Usagi, le samourai errant.