La saga de Usagi Yojimbo, le lapin samouraï, débute dans le Japon du XVIIe siècle. Le temps des guerres civiles est juste révolu et le Shogun a pris le pouvoir. Les samouraïs représentent la classe dominante du pays. Cependant, une période de troubles et d'intrigues politiques s'installe dans le pays...