En las oscuras calles de Nueva York, cuatro tortugas mutantes entrenadas en el ninjutsu por su maestro Splinter se enfrentan al clan Foot y a su líder, Shredder. Esta serie fundadora sigue Leonardo, Raphael, Donatello y Michelangelo en un universo que mezcla venganza, ciencia ficción y enfrentamientos brutales, antes de desenganchar su aventura hasta los Utroms y otros mundos.