Cuando Ysanne Isard, jefe de los Servicios Secretos Imperiales, descubre que el Emperador Pestage ha hecho un acuerdo con la Alianza, los Rebeldes parecen estar en mala posición. Pestagio es arrestado por traición y el escuadrón Rogue es enviado para liberarlo. Desafortunadamente para el escuadrón rebelde, Isard es despedido en el lugar con una flota de cruceros interestelares...