Après l'effondrement de la cité sous-marine et l'emprisonnement de l'âme de Poséidon, vaincu, dans l'urne sacrée, Athéna et ses chevaliers goûtent un repos bien mérité. Serait-il possible qu'une nouvelle menace choisisse précisément cet instant, où le Sanctuaire panse ses blessures et où la paix est encore fragile, pour se déclarer ? Lorsque le ciel s'obscurcit soudainement et que la lumière du Soleil pâlit, le doute n'est plus permit ! L'Empereur des Ténèbres, le dieu des Enfers, Hadès en personne, a libéré ses légions de Spectres et désire qu'on lui remette la tête d'Athéna comme trophée ! Devant l'invasion du Sanctuaire par les hordes maléfiques, les Chevaliers d'Or font front commun. Le compte à rebours des Douze Maisons du Zodiaque est de nouveau lancé ! Mais lorsque Seiya et ses compagnons, avertis du danger, débarquent pour prêter main forte dans les combats, ils sont repoussés sur ordre d'Athéna. Pourquoi refuse-t-on de les laisser participer à cette guerre qui menace directement la vie de leur déesse ? Doutes et incompréhensions se succèdent dans les esprits, tandis que les Chevaliers d'Or affrontent non seulement les Spectres de l'armée des Enfers, mais également d'anciens frères d'armes revenus à la vie...