Dans le Neo-Tokyo de 2019, une mégalopole reconstruite après une catastrophe qui a détruit l’ancienne capitale, Kaneda dirige une bande de motards adolescents souvent impliquée dans des affrontements violents. Après un accident, son ami Tetsuo est récupéré par l’armée, qui découvre chez lui d’étranges capacités psychiques. Tandis que ces pouvoirs deviennent de plus en plus difficiles à contrôler, Kaneda se retrouve mêlé à des expériences secrètes, à des luttes politiques et à la mystérieuse figure d’Akira, dont le nom reste lié à la destruction passée de Tokyo. L’escalade des événements menace bientôt l’équilibre fragile de toute la ville.