Bruce Wayne poursuit sa guerre contre le crime alors qu’une série de menaces remet progressivement en question tout ce qu’il croit savoir sur Batman. Entre manipulations psychologiques, sociétés secrètes et ennemis capables d’exploiter ses failles les plus profondes, il découvre que certaines forces travaillent contre lui depuis des années. Son parcours l’amène à affronter le Black Glove, le mystérieux Docteur Hurt et plusieurs figures liées à son passé, tout en découvrant l’existence de Damian Wayne, le fils qu’il a eu avec Talia al Ghul. De Gotham aux frontières du temps, puis jusqu’à la création de Batman Incorporated, Bruce cherche à transformer Batman d’un symbole solitaire en une idée capable de survivre à l’homme derrière le masque.