Le Midnight Channel fait son grand retour. Cela signifie-t-il que les autorités n'ont pas réussi à arrêter le véritable tueur ? Et que Soji, Yosuke et Chie vont devoir reprendre du service ? Quoi qu'il en soit, le jeune enquêteur Naoto Shirogame va être forcé d'affronter son propre Shadow.