Después de que un misterioso fenómeno petrifique a casi toda la humanidad durante varios milenios, Senku Ishigami despierta en un mundo donde la civilización ha desaparecido y la naturaleza ha recuperado su lugar. Apasionado por la ciencia, decide reconstruir progresivamente la sociedad humana recreando inventos, medicamentos, herramientas y tecnologías a partir de recursos naturales. Acompañado por varios supervivientes con talentos complementarios, Senku se enfrenta a las dificultades de un mundo que ha vuelto a un estado primitivo, pero también a quienes defienden una visión diferente del futuro. Su objetivo está claro: hacer renacer la civilización gracias al poder de la ciencia.