Logan se rend au Japon après avoir appris que Mariko Yashida, la femme qu’il aime, a été contrainte d’épouser un autre homme pour préserver l’honneur de son clan. Refusant de l’abandonner, Wolverine se retrouve entraîné dans les luttes de pouvoir de la famille Yashida, entre traditions, manipulations et affrontements avec des guerriers redoutables. Son voyage devient rapidement plus qu’une simple quête amoureuse : il l’oblige à confronter sa propre violence, son sens de l’honneur et la part animale qu’il porte en lui. Entre sabres, ninjas et conflits de loyauté, Logan tente de prouver qu’il peut être autre chose qu’une arme.