Wolverine dirige secrètement Psylocke, Fantomex, Archangel et Deadpool dans des missions que les X-Men ne peuvent assumer publiquement. Leur première cible est Apocalypse, revenu sous la forme d’un enfant. Le choix qu’ils font alors déclenche une suite de conséquences qui menace l’âme de l’équipe et l’avenir du monde mutant.