L'arrivée des Grenouilles punks met à mal l'équilibre du quartier mutant. Entre nouveaux venus et nouvelles menaces, les Tortues peinent à garder la ville sous contrôle ! L'absence de maître Splinter se fait cruellement sentir pendant les fêtes. Et qui est donc le mystérieux docteur Jasper Barlow ? Ce dernier propose aux mutants de regagner leur part d'humanité perdue. Mais derrière cette proposition alléchante se cachent de sinistres desseins. En parallèle, l'avenir des Tricératons et des Utroms s'apprête à changer à tout jamais...