Ethan Hunt a quitté Mission Impossible. Il forme désormais les futurs agents du gouvernement américain. Un poste qui devrait enfin lui permettre de mener une existence tranquille auprès de sa femme Julia. Mais quand Lindsey, l'une de ses élèves, est kidnappée à Berlin par Owen Davian, un trafiquant d'armes, Ethan se sent obligé de lui porter secours et repart, sans hésiter, en mission pour la libérer.